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理想的組織培養實驗室應該建立在安靜、清潔、遠離污染源的地方，應在常年主風向的上風方向，盡量減少污染。規模化生產的組織培養實驗室應該建在交通方便的地方，便于培養產品的運送。

組培實驗室設計均需考慮兩個方面的問題：一是所從事的實驗的性質，即是生產性的還是研究性的，是基本層次的還是較高層次的；二是實驗室的規模，規模主要取決于組培設備全套價格和實驗性質。  

無論組培室的性質和規模如何，組培室設置的基本原則是：科學、高效、經濟和實用。一個組織培養實驗室必須滿足3個基本的需要：實驗準備（培養基制備、器皿洗滌、培養基和培養器皿滅菌）、無菌操作和控制培養。此外，還可根據從事的實驗要求來考慮輔助實驗室及其各種附加設施，使實驗室更加完善。

在進行植物組織培養工作之前，首先應對工作中需要哪些基本的設備條件有個全面的了解，以便因地制宜地利用現有房屋，或新建、改建實驗室。實驗室的大小取決于工作的目的和規模。以工廠化生產為目的，實驗室規模太小，則會限制生產，影響效率。在設計組織培養實驗室時，應按組織培養程序來沒計，避免某些環節倒排，引起日后工作混亂。植物組織培養是在嚴格無菌的條件下進行的。要做到無菌的條件，需要一定的設備、器材和用具，同時還需要人工控制溫度、光照、濕度等培養條件。